北京大学第三医院(简称“北医三院”)始建于1958年，是卫生部部管的集医疗、教学、科研和预防保健为一体的现代化综合性三级甲等医院。现有在职职工2447人，开放床位1463张。医院设有34个临床科室、11个医技科室。拥有28个博士点、1个临床博士后流动站。在岗博士生导师55人，中科院院士1人、国家自然科学基金杰出青年基金获得者1人、科技部“973”首席科学家1人、教育部 “长江学者特聘教授”2人，1人入选国家级“新世纪百千万人才工程”。

骨科、药剂科(临床药学)、病理科、专科护理、检验科、消化科、妇科、产科、职业病科、耳鼻喉科、心血管分子生物学与调节肽重点实验室、呼吸内科、神经内科、普通外科、泌尿外科、眼科、麻醉科等十七个专科入选国家临床重点专科建设项目。

北医三院拥有国内最强的脊柱外科和中国大陆成立最早、亚洲最大的生殖医学中心之一，中国大陆首例试管婴儿在此诞生。运动医学研究所是中国最早成立、国内唯一的中国奥委会指定运动员伤病防治中心。眼科在眼外伤及眼科疑难重症的诊治方面处于国内领先水平;消化科在溃疡病发病机制研究及治疗、早期胃癌的诊疗等领域居国内前列;心血管内科在冠心病介入治疗、急性心肌梗死“绿色通道”及临床与基础协调发展等方面居国内一流水平;成形科、职业病科是国内率先成立的临床特色学科。

2012年，年门急诊量达350万余人次，年出院患者6.5万余人次，年手术量达4.4万余例次，平均住院日为6.62天，各项主要管理指标达先进水平，多次受到卫生部和北京市卫生局的表彰。在北医三院住院患者中，三分之一以上是来自全国各地的疑难杂症患者。

2012年，年门急诊量达350万余人次，年出院患者6.5万余人次，年手术量达4.4万余例次，平均住院日为6.62天，各项主要管理指标达先进水平，多次受到卫生部和北京市卫生局的表彰。在北医三院住院患者中，三分之一以上是来自全国各地的疑难杂症患者。

北医三院拥有骨科、运动医学研究所、妇产科3个教育部创新团队;拥有辅助生殖、心血管研究所和眼科3个教育部重点实验室;目前，32人次任主要系列学术兼职(二级分会主委或副主委)，涉及18个科室;29人次在中国科技论文统计源期刊收录杂志任主编或副主编，涉及15个科室。